根據(jù)《營業(yè)稅暫行條例》的規(guī)定，建筑業(yè)的總承包人將工程分包或者轉(zhuǎn)包給他人，以工程的全部承包額減去付給分包人或者轉(zhuǎn)包人的價款后的余額為營業(yè)額。也就是說，存在工程分包的情況下，總承包單位應以全部承包額減去付給分包方價款后的余額計算繳納營業(yè)稅，分包人應該就其完成的分包額承擔相應的納稅義務。同時，按照規(guī)定，總承包人屬于法定的代扣代繳納稅義務人，在與分包方辦理已完工程價款結(jié)算時，還應以與分包方結(jié)算的工程價款為依據(jù)計算并代扣代繳其營業(yè)稅。總承包人代扣代繳分包人營業(yè)稅后，應按規(guī)定對分包人開具《中華人民共和國代扣代收稅款憑證》，分包人以此作為其完稅憑證。

　　大型工程項目施工往往涉及多個行政區(qū)域，而營業(yè)稅屬于地方稅，由于地方利益競爭，在納稅實踐中分包工程的納稅地點有時也成為焦點問題。按照《營業(yè)稅暫行條例》的規(guī)定，建筑安裝業(yè)務實行分包或轉(zhuǎn)包的，總承包人應該按照建筑業(yè)營業(yè)稅納稅地點的規(guī)定，扣繳分包或轉(zhuǎn)包人應繳的營業(yè)稅，即建筑業(yè)營業(yè)稅的納稅地點在什么地方就在什么地方代扣代繳，具體來說就是：①非跨省工程的分包或轉(zhuǎn)包，由扣繳人在工程所在地代扣代繳。②跨省工程的分包或轉(zhuǎn)包，由扣繳人在扣繳人的機構所在地代扣代繳；如果分包或轉(zhuǎn)包人將工程再一次分包或轉(zhuǎn)包出去，有一段工程仍是跨省工程，該段跨省工程的營業(yè)稅亦由總承包人在其機構所在地代扣代繳。

　　如中鐵公司（駐北京）承包鄭州至武漢的某高速公路工程，把其中兩部分分包給甲、乙兩施工企業(yè)，分段分包或轉(zhuǎn)包后，如果沒有跨省，則這兩個施工企業(yè)應繳納的營業(yè)稅由中鐵公司代扣后，在工程所在地繳納；如果工程跨省，則跨省工程的營業(yè)稅，由中鐵公司代扣后在北京繳納；如果甲企業(yè)將所分包的跨省工程的一部分再次分包給丙、丁兩企業(yè)，若丙企業(yè)所分包的工程未跨省，其應繳營業(yè)稅由中鐵公司代扣后，在工程所在地繳納，若丙企業(yè)所分包的工程跨省，其應繳營業(yè)稅仍由中鐵公司代扣后在北京繳納。

　　另外，建筑安裝工程的總承包人為境外機構，且其在中國境內(nèi)沒有經(jīng)營機構或代理者的，不管此工程是否實行分包或轉(zhuǎn)包，全部工程應納的建筑業(yè)營業(yè)稅稅款均由建設單位扣繳。

　　在會計核算時，分包工程的營業(yè)稅等流轉(zhuǎn)稅由承包方代扣代繳，并由承包方從每期的分包進度款中扣回，這部分流轉(zhuǎn)稅形成分包方企業(yè)的營業(yè)稅金及附加；與承包方自行完成部分的營業(yè)額相關的流轉(zhuǎn)稅形成承包方企業(yè)的營業(yè)稅金及附加。